2016年6月下旬到7月中旬，南开大学世界近现代史研究中心按照教育部相关文件，根据教育部人文社科重点研究基地深化改革的指导精神，重新修订了基地在2015年制定的基地“十三五”发展规划和课题总体论证。基地在6月下旬召开基地教授会议，集中学习教育部深化基地改革的相关文件，广泛讨论基地“十三五”发展规划和课题论证的可行性和必要性。在此基础上，基地教授会议提出了基地发展规划的具体措施，以及基地重大课题的主攻方向“近代以来世界历史上的社会转型问题”。随后，基地主任杨栋梁教授、副主任赵学功教授和韩琦教授又多次与各位教授协商和讨论基地“十三五”课题规划和总体论证等重要事宜。6月底，基地按照基地初步拟定的“十三五”发展规划和课题主攻方向，起草课题总体论证，各位重大课题负责人设计各个重大课题论证。7月初，基地召开学术委员会电话会议。基地学术委员会的专家学者就基地“十三五”发展规划草案、“十三五”总体论证和各个重大课题论证进行广泛的讨论，并提出了诸多建设性意见。7月20日，基地在广泛听取基地专兼职研究员、基地学术委员会专家学者的意见基础上对基地“十三五”发展规划、主攻方向总体论证以及基地重大课题论证进行了修改并定稿。7月22日，基地结束基地“十三五”发展规划和科研规划的网上填报工作，紧张而高效地完成修订基地规划的重要工作。相信经过修订的“十三五”规划和课题论证，能够成为基地未来五年发展的指导性文件，起到规划基地管理、引领基地科研发展的重要作用。